海洋學院成立于2002 年7月。建院以來，學院依托海南豐富的海洋資源，以熱帶海洋資源研究、開發利用和保護為特色，創辦與經濟建設緊密聯系的專業，發展海洋科學技術，為我國海洋現代化建設輸送各類應用型高素質人才。經過多年的建設，學院的師資隊伍建設、學科建設、辦學規模、科學研究和實驗室建設都得到了快速發展，并獲得了許多榮譽稱號。2007年學院被授予海南省教育系統先進集體；2005年、2007年海洋生物實驗室被評為省優秀實驗室；水產系被全國總工會命名為“全國先進班組”，榮獲“五一勞動獎狀”，有多位教師獲得各種榮譽和表彰。成為海南省海洋科學領域科學研究和人才培養的主要基地 。
學院現有教職工51 名，其中教師41名，具有副高以上專業技術職務者33人，具有博士學位16人，碩士學位15人，學院特聘林浩然院士為雙聘院士。有國家級有突出貢獻專家1 人、享受國務院津貼專家5 人、省優專家1人，省突出貢獻專家1人，全國先進工作者2人， 新世紀“百千萬人才工程”國家級人選1 人、新世紀優秀人才支持計劃人選1人、全國優秀教師1人、海南省教學名師1人和海南省高等院校青年教師“教學十佳”1人。形成了一支思想政治素質高，愛崗敬業，學歷較高和職稱結構合理的，能夠滿足教學和科研需要的師資隊伍。
學院設有水產養殖專業、制藥工程專業、海洋科學三個本科專業，水產養殖學、海洋生物學二個碩士學位點和一個漁業領域農業推廣碩士點，海洋生物實驗教學中心；熱帶生物資源教育部實驗室的海水動物繁育和病害控制研究室、海水動物種質改良研究室、海洋生物研究室；海南省熱帶水生生物重點實驗室。2003年經海南省科技廳批準成為海南 —東盟科技合作基地，2007年“水產養殖專業”被教育部、財政部批準為第一類高等學校特色專業建設點。目前有在校研究生64人，本科生640人 。生源來自除上海和西藏以外的所有省市。
學院有海南省級重點學科—水產養殖學、校級重點學科—海洋生物學。水產養殖學設有熱帶水產養殖生物生殖調控與繁育、熱帶水產養殖生物遺傳育種、熱帶水產養殖生物病害與控制、熱帶水產養殖生物開發利用生物技術等四個重點研究方向。海洋生物學設有應用海洋生物技術、海洋生物資源的保護與開發利用兩個研究方向。
學院海洋生物實驗教學中心，下設養殖學實驗室、生物學實驗室、生物技術實驗室、藥學實驗室、海洋生物實驗室、海洋環境生態實驗室和熱帶水生生物技術實驗室。擁有力量較為雄厚的實驗教學隊伍, 美觀、寬敞的實驗教學大樓和先進的儀器設備 。實驗室總使用面積為 3596 m2 ，教學儀器設備總值931萬元。承擔著學院三個專業的實驗教學任務。2005年、2007年海洋生物實驗室被評為省優秀實驗室；2006年中心被批準成為海南省省級實驗教學示范中心建設點，2008年被評為教育部實驗教學示范中心建設單位。學院與企業聯合建立了15個校外科研、教學實習基地。
學院擁有一批從事魚、蝦、蟹、貝、藻類研究和養殖技術開發專家，他們在水產養殖、海洋生物資源研究與開發中發揮重要的作用。學科隊伍結構合理、科研能力強、學術水平較高，是海南省從事水產養殖、海洋科學領域研究的主要技術力量。近五年來，學院共承擔科研項目190余項，科研總經費達到 2600多萬元，其中國家和部級重大科技項目70余項，經費2000余萬元。承擔和完成國家“863”和“科技支撐”高技術項目《名貴海水魚類苗種規模化繁育技術》等18項，國家自然科學基金課題《馬氏珠母貝養殖群體對海南島東部野生種群遺傳多樣性的影響》等20項(其中國際合作3項)，部、省級重大科技項目《海水養殖魚蝦病害的免疫防治研究》等21項(其中國際合作10項) ，省自然科學基金項目26項，其它課題100余項。科研成果豐碩，獲得國家科技進步二等獎等各類科技進步獎14項，申請專利20項，獲得專利授權7項，通過國家或省級鑒定、驗收的科技成果30項；主編出版專著19部，參編著作18部，出版教材3部；發表學術論文共290多篇 (SCI收錄24篇、EI收錄2篇)。
學院十分重視科技成果的轉化工作，設有“產學研”基地4處區，馬氏珠母貝海大“海優1號”育苗和養殖技術已在廣東、廣西和海南三省區大面積推廣應用；“點帶石斑魚規模化人工繁育技術研究”實現了點帶石斑魚規模化人工繁育，成果總體達到國際先進水平，以“碎屑食物鏈”為基礎的點帶石斑魚工廠化育苗技術屬于國內外首創。國家領導人曾多次視察學科的產業化基地。學科建設大大提升了學院的教學質量、科研水平和為社會服務能力，增強了教師和學生的自主創新能力。
學院設有學校圖書館二級館，藏有多種專業科技期刊和書籍，有過刊286 種，共4934 冊（合訂本），現刊67種；藏書量2421 種，共4230 冊。 配備有公用上網電腦。
學院堅持以理想信念教育為核心，以服務學生成長成才為原則，以培養具有創新精神和實踐能力的大學生為目標，在“建設、服務、創新”的工作理念指導下，充分挖掘工作內涵，不斷創新工作內容，打造了“學生科研能力訓練營”、“傳遞愛心 成就你我 共筑和諧——海洋學院資助家庭經濟困難學生系列活動”、學生黨員“四個一”工程等精品活動，開展了校園十大歌手、辯論賽、演講比賽、征文比賽等一系列豐富多彩的校園文化活動，尤其是在歷屆“挑戰杯”全國大學生課外科技作品競賽和中國大學生創業計劃競賽均取得了較好的成績，學生科研工作走在學校的前列。學生綜合素質較高，普遍受到用人單位歡迎，我院2008屆畢業生初次就業率達到了92.56%。
學院近期發展規劃以設立應用性學科為主，中期發展規劃為在加強應用型學科基礎上，逐步發展基礎學科；學院的長期目標是以南海熱帶海洋為依托，構建較為完整的海洋科學研究、教學體系，成為我國熱帶海洋科學的教學、研究基地。為國家培養具有扎實基礎理論和操作技能的 21 世紀創新型人材，為發展我國海洋經濟做出貢獻。