院長辦公室是醫院行政工作的綜合辦事機構，也是醫院領導聯系各科室的橋梁。在院長的直接領導下開展工作，實行辦公室主任負責制，主要職責如下：
1、組織或協同有關部門做好以醫院行政名義舉行的全院性重要活動及重要會議的準備工作;負責院長辦公會議的會務工作;決議文件的下發、傳送及督辦工作。
2、負責醫院文件、院長辦公會和院領導所需材料的起草和整理工作;組織起草全院行政工作綜合性計劃、總結、報告、規劃和決定等文件;負責醫院事務信息的發布。
3、負責傳達上級部門的文件和通知;負責全院的文秘、行政管理工作;做好行政公文的審核、收發、登記、傳遞、傳閱、立卷歸案、保管利用工作。
4、接待職工來信、來訪，負責并督促有關部門對來信、來訪者提出的問題做出答復。
5、負責協調各工作部門的工作，審核各職能部門以醫院名義發出的各種文件。督促檢查醫院行政各部門對醫院文件、會議決定事項的執行落實情況。
6、承擔醫院對外的事務聯系、協調和接待工作。
7、負責全院綜合檔案的管理、立卷、歸檔及查閱工作，保證各種文件的完整性、保密性和安全性，及時提供利用。
8、負責醫院印鑒的保管和使用，審核、監管各工作部門印鑒的刻制、啟用等。
9、圍繞醫院重點工作開展經常性的調查研究，提供可行性方案，為領導決策，當好參謀助手。
10、做好車輛使用的管理工作，保障公務用車。
11、協調處理醫院重大突發事件。
12、承辦院領導交辦的其它臨時性事務。